清嘉慶年間(西元1796~1820)有一尊媽祖神像漂流至野柳海岸，被漁民發現迎回，設壇奉祀，因為信徒日增，嘉慶十四年(西元1809年)在金包里街現址擴建，命名為天后宮。後來歷經光緒年間、同治年間，及二戰後幾次擴建、整修，成為今日之樣貎。現廟內尚存同治癸酉十二年(西元1873年)的龍柱，浮雕雅緻，其餘廊、殿、亭、樓，建物雖新，卻失其樸拙。然而細緻的雕工，不亞於三峽之祖師廟。
慈護宮是金山地區漢人民俗信仰中心，俗稱「大廟」。主祀媽祖，但也兼祀孔子、關帝、水仙尊王、神農大帝及佛祖。呈現民間「儒、釋、道」三教合一的包容精神。
每年農曆三月二十三日為迎媽祖之日，熱鬧非凡， 是金山地區之勝事。
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